Geralmente, é realizado em ambulatório, com o paciente acordado, com anestesia local (nas narinas e na garganta). Antes da phmetria, se faz necessário a realização de um exame chamado manometria esofágica, este exame é fundamental para a determinação do local correto de posicionamento da sonda de pHmetria. A manometria esofágica localiza o esfíncter esofagiano inferior (EEI) – estrutura responsável pelo “fechamento” da passagem entre o esôfago e o estômago, bem como evidencia possíveis alterações no funcionamento deste esfíncter. Após termos a localização correta do EEI, a sonda de pHmetria é posicionada 5 cm acima deste.

A sonda é ligada a um Holter e permanece no corpo do paciente por cerca de 24 horas, no dia seguinte, o Holter e a sonda são retirados, o paciente deve preencher um questionário para registrar suas atividades enquanto esteve com a sonda (horário de alimentação, sintomas, horário de sono, tempo em que ficou em pé ou sentado etc.).

Com os dados coletados pela sonda e o questionário preenchido pelo paciente, o médico é capaz de dar o diagnóstico definitivo da doença do refluxo gastroesofágico.

Após a retirada da sonda – que dura em torno de um minuto –, o paciente pode sentir algum incômodo (devido à passagem da sonda), no entanto, não é grave e é permitido retornar às atividades normalmente.